La trypsine appartient à la famille des protéases à sérine. Elle hydrolyse les liaisons peptidiques, en particulier après les acides aminés lysine ou arginine. La trypsine utilise une triade catalytique (sérine, histidine et aspartate) pour effectuer une attaque nucléophile sur les liaisons peptidiques. Le substrat s'insère dans la poche S1 de l'enzyme, qui présente une grande spécificité pour les résidus basiques.
Trypsine
| CAS No: | 9002-07-07 |
| EINECS No: | 232-650-8 |
| EC No: | 3.4.21.4 |
| Synonymes: | trypsine du pancréas bovin, trypsine du pancréas porcin, protéase pancréatique, trypsine pancréatique, parenzyme, sérine protéase trypsine, trypsine 1, sérine endopeptidase trypsine, trypsinase, trypsinum, trypase |
Résumé du produit
La trypsine est une enzyme sérine-protéase généralement dérivée du pancréas de porc ou de bovin. Elle joue un rôle essentiel dans la digestion des protéines en coupant les liaisons peptidiques du côté carboxyle des résidus lysine et arginine. En biotechnologie et en biochimie, la trypsine est largement utilisée pour la recherche sur les protéines et les cellules en raison de son mode de clivage hautement spécifique et de sa compatibilité avec les conditions physiologiques. Le trypsinogène est le précurseur inactif de la trypsine.
Fonction et mécanisme d'action
Applications
- Biologie cellulaire: Détachement de cellules adhérentes pendant le passage (par exemple, dans les cultures de tissus).
- Protéomique et spectrométrie de masse (MS): utilisée en protéomique ascendante pour décomposer les protéines en vue d'une analyse MS ; les enzymes mixtes trypsine/Lys-C améliorent l'identification des peptides dans les études protéomiques.
- Biologie moléculaire: Isolement et purification des protéines recombinantes.
Conditionnement et stockage
- Source : pancréas de porc ou de bovin
- Pas moins de 2500 unités de trypsine USP/mg, trypsine 1:250 et trypsine 30 unités FIP/mg sont disponibles.
- Disponible sous forme de poudre lyophilisée.
- Conserver dans un récipient hermétique à une température comprise entre 2 et 8°C, à l'abri de la lumière.
Références
- Deng Y, et al. 2022: Comparison of protein hydrolysis catalyzed by bovine, porcine, and human trypsins, J Agric Food Chem. 66(16):4219–32.
- Szmola R, et al. 2003: Human mesotrypsin is a unique digestive protease specialized for the degradation of trypsin inhibitors, J Biol Chem. 278(49):48580-9.
- Szmola R, Sahin-Tóth M. 2007: Chymotrypsin C (caldecrin) promotes degradation of human cationic trypsin: identity with Rinderknecht's enzyme Y, Proc Natl Acad Sci U S A. 104(27):11227-32.
- Ma W, et al. 2005: Specificity of trypsin and chymotrypsin: loop motion controlled dynamic correlation as a determinant, Biophys J. 89(2):1183–93.
- Gui F, et al. 2020: Trypsin activity governs increased susceptibility to pancreatitis in mice expressing human PRSS1R122H, J Clin Invest. 130(1):189-202.
- Lerch MM, et al. 2000: The role of cysteine proteases in intracellular pancreatic serine protease activation, Adv Exp Med Biol. 477:403-11.
- Vandermarliere E, et al. 2013: Getting intimate with trypsin, the leading protease in proteomics, Mass Spectrom Rev. 32(6):453-65.
- Peräkylä M, Kollman PA. 2000: Why does trypsin cleave BPTI so slowly?, J Am Chem Soc. 122(14):3436–44.
- Buchholz I. et al. 2020: The impact of physiological stress conditions on protein structure and trypsin inhibition of serine protease inhibitor Kazal type 1 (SPINK1) and its N34S variant, Biochim Biophys Acta Proteins Proteom. 1868(1):140281.
- Huber R, Bode W. 1978: Structural basis of the activation and action of trypsin, Acc Chem Res. 11(3):114–122.
- Šlechtová T, et al. 2015: Insight into trypsin miscleavage: Comparison of kinetic Constants of problematic peptide sequences, Anal Chem. 87(15):7636–43.
- Xia Y-L, et al. 2020: The energetic origin of different catalytic activities in temperature-adapted trypsins, ACS Omega. 5(39):25077-86.